Maestría Facultad de Ciencias Biológicas

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    Evaluación de la influencia del proceso tafonómico en la obtención de ADN a partir de tejido óseo humano a través de tres metodologías de extracción
    (Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2023) Portuguez Ramírez, Lucero Illariy; Vivas Ruiz, Dan Erick
    Determina el impacto de los factores tafonómicos (ácido, alcalino, húmedo/fúngico) en el ADN extraído de muestras óseas antiguas, para comparar tres métodos de extracción y evaluar la eficacia y rendimiento de esta molécula en la investigación. Las metodologías de extracción de la molécula de ADN, a partir de muestras óseas, se rigen con el empleo de técnicas complejas, que con frecuencia tienen que lidiar a diario con serios problemas como el que la muestra se encuentre degradada, la ausencia o escasa cantidad de ADN; así como la presencia de inhibidores que pueden ser extraídos conjuntamente con el ADN. La investigación se realizó para comparar la eficacia de tres procedimientos de extracción de ADN, que a su vez resulten amplificables mediante la técnica de Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR por sus siglas en inglés) a partir de restos óseos antiguos. De esta manera, se logró evaluar, comparativamente, la presencia de ADN en la muestra, los posibles inhibidores presentes y la procedencia de las mismas para las tres metodologías de extracción: la orgánica, la de desmineralización basada en las aplicaciones y sugerencias de la Comisión Internacional de Personas Desaparecidas (ICMP por sus siglas en inglés) y la metodología que utiliza el Kit de extracción de QIAgen®. Se emplearon inicialmente 169 muestras óseas antiguas recuperadas de fosas clandestinas, las mismas que se encontraron expuestas a diversos medios tafonómicos, que corresponden principalmente a tres mecanismos deteriorantes: impacto ácido, alcalino y microbiano.
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    Identificación de genes de resistencia a antimicrobianos en coprolitos provenientes de los antiguos pobladores de la civilización Caral
    (Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2026) Vásquez Domínguez, Andrés Martín; García de la Guarda, Ruth Hortensia; Jaramillo Valverde, Luis José
    El estudio tuvo como objetivo caracterizar el resistoma y la diversidad del microbioma intestinal a partir de ADN antiguo (aDNA) obtenido de 44 coprolitos humanos procedentes de la Ciudad Sagrada de Caral. Para ello, se aplicaron técnicas de biología molecular y análisis metagenómico, incluyendo la extracción de aDNA in situ mediante un laboratorio móvil y el análisis de las regiones 16S rRNA (V4) e ITS1 para la identificación de bacterias y hongos, respectivamente. Mediante secuenciación masiva se identificaron como grupos predominantes Bacillota, con Bacillus sp. como género más abundante, y los hongos Ascomycota y Basidiomycota, destacando Aspergillus sp.; asimismo, la presencia de Ruminococcus y Prevotella fue compatible con microbioma intestinal humano. Se identificaron diversos genes de resistencia a antimicrobianos asociados con resistencia a antibióticos de amplio espectro, glucopéptidos, fluoroquinolonas, macrólidos, lincosamidas y sulfonamidas. Además, se reconocieron rutas metabólicas relacionadas con la fermentación de polisacáridos, la producción de ácidos grasos de cadena corta, el metabolismo de lípidos y el funcionamiento de transportadores ABC. Los resultados evidencian que el microbioma intestinal precolombino de las muestras analizadas albergaba un resistoma complejo previo a la era antibiótica. Se concluye que el estudio constituye una contribución pionera al análisis metagenómico del resistoma ancestral en coprolitos humanos de la civilización Caral y proporciona bases para la estandarización de protocolos orientados al estudio evolutivo del resistoma ancestral peruano.
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    Taxonomía del género Abuta Aublet (Menispermaceae) en Perú y códigos de barras como herramienta para su identificación
    (Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2026) Zañartu Flores, Ricardo Arturo; Cano Echevarría, Asunción Alipio
    El estudio presenta una revisión taxonómica del género Abuta Aubl. (Anomospermeae, Menispermaceae) para el Perú, grupo neotropical caracterizado por determinadas características morfológicas de sus estructuras florales y reproductivas. Se reconocen quince especies, incluidas tres posibles especies nuevas denominadas provisionalmente Abuta sp. 1, Abuta sp. 2 y Abuta sp. 5, además del complejo taxonómico Abuta grandifolia s. lat. El trabajo proporciona tres claves de identificación basadas en caracteres vegetativos, inflorescencias y flores masculinas, así como material pistilado, infrutescencias y frutos. Asimismo, se presentan descripciones detalladas, mapas de distribución y una evaluación preliminar del estado de conservación de las especies reconocidas en el territorio peruano. Como complemento, se incorpora información sobre códigos de barras de ADN y un análisis comparativo del rendimiento de los marcadores moleculares empleados para la identificación de los taxones, incluyendo la evaluación de la variación de nucleótidos y la identificación de sitios diagnósticos. El estudio contribuye al conocimiento taxonómico y molecular del género Abuta en el Perú y proporciona herramientas para su identificación, distribución y evaluación de conservación.