Caracterización del microbioma oral usando tecnología de Oxford Nanopore en niños peruanos, 2024

Abstract

El estudio tuvo como objetivo caracterizar los comensales orales del microbioma bucal mediante la tecnología Oxford Nanopore en niños peruanos con y sin caries dental. La metodología consistió en la recolección de muestras de saliva no estimulada de 30 niños, a quienes se les realizó un examen oral previo para diagnosticar la presencia de caries y cuantificar las piezas afectadas. En el laboratorio, se efectuó la extracción del ADN, la preparación de la librería y la secuenciación genética utilizando un secuenciador MinION. Se aplicó un análisis descriptivo para determinar la abundancia relativa según phylum, género y especie. Los resultados obtenidos mediante el flujo de trabajo wf-16s nextflow v1.2.0 mostraron que, en el grupo con caries, predominaron los phyla Firmicutes (35%) y Proteobacteria (1.04%), los géneros Streptococcus (31.66%) y Veillonella (1.20%), y las especies Streptococcus salivarius (16.33%) y Streptococcus parasanguinis (3.54%). En el grupo sin caries, los valores fueron Firmicutes (29.90%) y Proteobacteria (2.54%) para phylum, Streptococcus (27.33%) y Veillonella (0.31%) para género, y Streptococcus salivarius (12.15%) y Streptococcus parasanguinis (2.25%) para especie. Se concluyó que la abundancia y diversidad del microbioma oral difieren significativamente entre los niños con caries y aquellos sin caries, evidenciando una posible relación entre la composición bacteriana y la presencia de la enfermedad.