Detección y caracterización molecular de los diferentes serotipos de Orthoreovirus mamífero que circulan en alpacas (Vicugna pacos) y llamas (Llama glama) neonatas de tres comunidades campesinas de la provincia de Canchis, departamento de Cusco

Abstract

Los virus que comprenden la especie Orthoreovirus mamífero son patógenos virales que están tomando más importancia en la actualidad. Generalmente causan infecciones asintomáticas o con leves cuadros entéricos o respiratorios. Últimos estudios están identificando la presencia de este virus en cuadros diarreicos más severos en diversas especies animales; sin embargo, el conocimiento de la presencia y caracterización de este virus en Camélidos sudamericanos fuera de este trabajo no ha sido reportado. El objetivo principal de este estudio fue detectar la presencia de Orthoreovirus mamífero (MRV) y determinar el serotipo de las estirpes virales que circulan en alpacas y llamas neonatas de tres comunidades campesinas localizadas en los distritos de Marangani y Sicuani de la provincia de Canchis, departamento del Cuzco. Para ello, 80 muestras de heces diarreicas y no diarreicas fueron recolectadas de alpacas de 1 a 5 semanas de edad provenientes de las comunidades campesinas de Pataccalasaya (n=12), Quisini (n= 23), Silly (n= 33) y llamas dentro del mismo rango de edad de Silly (n=12). Para la detección de MRV, el ARN viral fue extraído con Trizol® LS (Tiocianato de guanidina - fenol) y luego sometido a una RT-PCR usando cebadores específicos para la amplificación de una región conservada del gen L1 que codifica la ARN dependiente de la ARN polimerasa (RdRp) de todos los serotipos de MRV. Las muestras positivas a MRV fueron seguidamente analizadas por otra RT-PCR para la identificación del serotipo. De las 80 muestras analizadas, 40 (50%) fueron positivas a MRV. La frecuencia de MRV entre alpacas neonatas de Silly, Quisini y Pataccalasaya fue de 66.66%, 34.78% y 33.33% respectivamente y de llamas de Silly fue de 50%. De las 40 muestras positivas solo se pudo identificar al serotipo MRV1 en 4 muestras y MRV2 en 1 muestra. No se llegaron a identificar los demás serotipos. La confirmación del serotipo se realizó por secuenciamiento clásico para el gen sigma 1. Nuestro estudio sienta las bases para futuros estudios de epidemiología molecular de MRV en Camélidos sudamericanos en las comunidades campesinas de Perú, esto nos ayudará a desarrollar programas sanitarios y de prevención para la salud animal y humana debido al potencial zoonótico que posee este virus.