Caracterización de las variantes de coronavirus presentes en especies de murciélagos de Cataluña – España

Abstract

La emergencia sanitaria provocada por el coronavirus SARS-CoV-2, ha incrementado la tasa de fallecimientos a nivel mundial y ha resaltado la importancia de comprender la diversidad de estos virus. Diversos estudios indican que los murciélagos son reservorios de una gran cantidad de coronavirus, entre ellos, patógenos que pueden infectar a humanos. El objetivo de la presente investigación fue identificar los coronavirus presentes en muestras de epitelio nasofaríngeo de especies de murciélagos de Cataluña, España, y explorar de forma preliminar sus relaciones filogenéticas con el SARS-CoV-2. Cataluña muestra la mayor cantidad de especies de murciélagos en la península Ibérica, siendo los géneros más representativos Pipistrellus, Myotis y Barbastella. A partir de 100 muestras de hisopado nasofaríngeo de murciélagos de 15 especies presentes en Cataluña. Se aplicaron diferentes métodos de amplificación de secuencias, estrategias de metabarcoding, secuenciación de siguiente generación (NGS) y bioinformática. Solo se detectaron coronavirus en tres especies de murciélagos: seis especies de coronavirus en muestras de Barbastella barbastellus (N= 5), cinco en Myotis bechsteinii (N= 22) y nueve en Myotis emarginatus (N= 5). Entre estos virus, se identificaron dos relacionados filogenéticamente a los del tipo SARS-CoV, por lo que podrían tener potencial patógeno para el ser humano. Por este motivo, parece razonable recomendar estudios que aborden una posible zoonosis como la causante de la última pandemia de COVID-19. Asimismo, los resultados obtenidos podrían servir de apoyo en la búsqueda del origen específico del SARS-CoV-2.