Identificación de nuevos virus en variedades de Solanum tuberosum L. (Solanaceae) mediante secuenciación de alto rendimiento de ARN de interferencia y obtención de genomas virales en muestras provenientes de Cusco, Perú

Abstract

La investigación analiza la identificación de virus en cultivos de papa mediante la metodología de secuenciación de alto rendimiento de siARN, considerando la importancia de este cultivo para la seguridad alimentaria mundial y las amenazas fitosanitarias asociadas a infecciones virales. Para el estudio se recolectaron hojas de 144 plantas de papa procedentes de 12 localidades de Cusco, realizándose la preparación de librerías de siARN y el análisis bioinformático mediante los programas VirusDetect y VirFind. Asimismo, se efectuaron pruebas de PCR para completar secuencias faltantes y se utilizó el software Mega X para el análisis filogenético. Los resultados evidenciaron que VirusDetect proporcionó mayor información sobre secuencias virales en comparación con VirFind. El análisis filogenético permitió identificar un nuevo Torradovirus filogenéticamente relacionado con Squash chlorotic leaf spot virus, con un 71,52 % de identidad, además de un nuevo Badnavirus cercano evolutivamente a Canna yellow mottle virus, con un 73,3 % de identidad. Se concluye que la secuenciación de alto rendimiento de siARN constituye una herramienta eficaz para la detección e identificación de nuevos virus en plantas de papa.