Diversidad genotípica y evolución molecular del DENV-2 en las zonas endémicas de síndromes febriles: Huánuco, Madre de Dios, Piura y Cajamarca en el período 2016-2022

Abstract

La investigación tuvo como objetivo caracterizar molecularmente, evaluar la diversidad genética y reconstruir la historia evolutiva del virus del dengue serotipo 2 (DENV-2) circulante en cuatro regiones endémicas del Perú durante el periodo 2016–2022. Se analizaron 5394 muestras de suero de pacientes con enfermedad febril aguda para la detección de DENV y DENV-2 mediante reacción en cadena de la polimerasa con transcripción reversa en tiempo real (RT-PCR). Posteriormente, se amplificó y secuenció el gen de la envoltura (E) mediante el método de Sanger, y se realizaron análisis filogenéticos utilizando los métodos de máxima verosimilitud y análisis bayesiano por cadenas de Markov Monte Carlo. Asimismo, se evaluó el polimorfismo de aminoácidos y se identificaron los principales sitios antigénicos. Se obtuvieron 49 secuencias completas del gen E, cuyos análisis revelaron la circulación de dos genotipos de DENV-2 en el país: el genotipo Americano/Asiático, caracterizado por una elevada diversidad genética y la presencia de variantes autóctonas con distribución geográfica y temporal diferenciada, y el genotipo Cosmopolita, asociado a los brotes más recientes y con evidencia de establecimiento y diversificación local. Se concluye que la caracterización molecular y el análisis filogenético del DENV-2 aportan información relevante para fortalecer la vigilancia genómica del dengue y contribuir a la detección temprana de variantes con potencial impacto en la salud pública.