Análisis transcriptómico in silico de genes asociados a interferones en muestras de cáncer de mama triple negativo

Abstract

Actualmente, el cáncer de mama es la neoplasia con mayor incidencia y mortalidad en mujeres a nivel mundial y nacional. En el Perú, aproximadamente el 18 % de los casos corresponden al subtipo triple negativo, el cual presenta el peor pronóstico debido a su alta agresividad y a la ausencia de terapias dirigidas eficaces. Considerando que el microambiente tumoral influye de manera determinante en el comportamiento del cáncer, el presente estudio tuvo como objetivo analizar la expresión génica de vías relacionadas con interferones en muestras de cáncer de mama triple negativo, comparándolas con tejido no tumoral (Control), tejido adyacente (TA) y con cáncer de mama no triple negativo (CMnTN). Se emplearon herramientas bioinformáticas como RUV-Seq, DESeq2 y clusterProfiler, utilizando datos transcriptómicos provenientes de bases de datos públicas como The Cancer Genome Atlas y Genotype-Tissue Expression, así como conjuntos génicos de vías de interferón obtenidos de la Molecular Signatures Database. Los resultados evidenciaron, principalmente, que los genes asociados a la vía de interferón tipo II presentan una mayor expresión en el cáncer de mama triple negativo en comparación con los grupos Control, TA y CMnTN, lo que sugiere que esta vía podría tener una influencia predominante en las características biológicas de este subtipo tumoral.