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Comparación de grupos filogenéticos y genes de resistencia a betalactámicos de Escherichia coli entre aislamientos de muestras clínicas y colonizantes intestinales
(Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2023) Matta Chuquisapon, Jose Fernando; Barrón Pastor, Heli Jaime
Compara las diferencias de grupos filogenéticos y genes de resistencia a betalactámicos de Escherichia coli entre aislamientos de muestras clínicas y colonizantes intestinales de portadores sanos. Estudio transversal. Se incluyeron 113 aislamientos de Escherichia coli productoras de betalactamasa de espectro extendido. Estas fueron obtenidas de aislamientos clínicos (67) y de muestras de hisopados anales (46) de pacientes hospitalizados en el Instituto Nacional de Enfermedades Neoplásicas durante el 2017. Se buscó determinar diferencias significativas entre los grupos filogenéticos de cada grupo (muestras clínicas e hisopados anales). Para esto, se determinó el grupo filogenético mediante el método de Clermont et al., se describió el perfil de resistencia a los antibióticos, los genes de resistencia de acuerdo con los servicios de hospitalización de donde fueron recuperados. El grupo filogenético más frecuente en las muestras clínicas fue el B2 (35,6%) y en las muestras de hisopado fueron D o E (29,5%). Se encontró diferencia significativa entre los grupos filogenéticos y el tipo del aislamiento, siendo las muestras clínicas los de mayor probabilidad de ser filogrupo B1 (OR = 8,78 [IC 95%: 1,08-71,38]). Además, se evidenció una frecuencia de 84% para el gen CTX-M, resistencia a ciprofloxacino (78% para hisopados anales y 91% para muestras clínicas) y gentamicina (51% para muestras clínicas y 61% para hisopados anales) y amikacina (3% para muestras clínicas y 15% para hisopados anales). Se evidencia una gran diversidad en los grupos filogenéticos de Escherichia coli aisladas de muestras clínicas y de hisopados anales. Se demostró que existen diferencias significativas entre los grupos filogeneticos de cepas de Escherichia coli aisladas de muestras clínicas y de hisopados anales. Además, se encontró una alta frecuencia de betalactamasa tipo CTX-M, y una alta frecuencia de resistencia a quinolonas y aminoglucósidos
Frecuencia de genes fimH y afa en Escherichia coli productoras de betalactamasas de espectro extendido aisladas de urocultivos
(Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2018) Matta Chuquisapon, Jose Fernando; Marocho Chahuayo, Luis Jesús; Valencia Bazalar, Esther Lilia; Gonzales Escalante, Edgar; Sevilla Andrade, Carlos Raúl
Escherichia coli es el bacilo Gram negativo aislado con mayor frecuencia en las infecciones del tracto urinario en pacientes ambulatorios y hospitalizados. La gravedad de la infección dependerá de los factores de virulencia que tenga y de los mecanismos de resistencia a los antimicrobianos como las betalactamasa de espectro extendido (BLEE) que confieren un perfil de multirresistencia. Se desconocen referencias del perfil de virulencia de las cepas causantes de infecciones del tracto urinario en nuestro medio. Realiza un estudio transversal, prospectivo y descriptivo. La investigación determina la frecuencia de los genes de las adhesinas fimH y afa en cepas de Escherichia coli productoras de BLEE aisladas de urocultivos. Así mismo, describe la resistencia acompañante de las cepas de Escherichia coli productora de BLEE, su distribución por procedencia y grupo etario. Se estudiaron un total de 75 aislados de Escherichia coli productoras de BLEE pertenecientes al cepario obtenido del proyecto TO-06/09 realizado en el INSN durante el periodo octubre - diciembre del 2012 almacenadas en el Instituto de Medicina Tropical “Daniel Alcides Carrión” de la Facultad de Medicina de la UNMSM. A todos los aislados se les realizó la detección genotípica de los genes fimH y afa a través de una PCR convencional. Encuentra que para el gen fimH, se obtuvo una frecuencia de positivos del 98,6 % (74/75), para el gen afa una frecuencia del 8 % (6/75). No se observó una posible asociación entre los factores de virulencia y la edad, ni procedencia. El gen fimH tampoco tuvo asociación con respecto al perfil de resistencia, pero el gen afa si mostró una posible asociación con un antibiótico aminoglucósido. Se halló una alta frecuencia para el gen fimH y una baja frecuencia para el gen afa. No se observó una posible asociación entre los factores de virulencia con las demás variables (edad, procedencia, perfil de resistencia) con excepción de afa y su relación significativa con amikacina.