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Capacidad antagonista de actinomicetos aislados de la rizósfera de la papa (Solanum tuberosum sp. andigena) para el control de hongos fitopatógenos de importancia agrícola
(Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2016) Caro Castro, Junior Jair; León Quispe, Jorge
Determina la capacidad antagonista de actinomicetos aislados de la rizósfera de plantaciones de papa colectadas en la localidad de Andahuaylas en la región de Apurímac, frente a cuatro hongos fitopatógenos de importancia agrícola: Fusarium sp., Lasiodiplodia sp., Rhizoctonia solani y Phytophthora infestans. Se aisla 49 cepas de actinomicetos, en su mayoría caracterizadas fenotípicamente como Streptomyces sp. El 69,4% (34) de estas cepas inhibe el crecimiento del hongo Fusarium sp., el 44,9% (22) presenta capacidad antagónica frente a Lasiodiplodia sp., el 55,1% (27) es antagonista de Rhizoctonia solani y el 46,9% (23) frente a Phytophthora infestans; mientras que el 38.8% (19) es antagonista de los cuatro hongos evaluados. Se observa que el crecimiento de los actinomicetos se ve fuertemente influenciado por las bajas temperaturas y pHs bajos. Los extractos orgánicos de la cepa AND 24 obtenidos con diclorometano y etil acetato revelan actividad antifúngica frente a Lasiodiplodia sp., mientras que el extracto butanólico muestra actividad antifúngica frente a Fusarium sp. El análisis filogenético del gen del ADNr 16S revela que el actinomiceto en cuestión es probablemente Streptomyces sampsonii. Concluye que los actinomicetos rizosféricos de la papa son excelentes productores de compuestos bioactivos capaces de inhibir notablemente el desarrollo de hongos fitopatógenos, por lo que se considera como potenciales candidatos a ser utilizados en programas de control biológico de plagas que afectan la papa.
Estudio de la diversidad molecular de aislados clínicos de Vibrio parahaemolyticus en el periodo 1995-2017
(Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2020) Caro Castro, Junior Jair; Alvarado Iparraguirre, Débora Elizabeth; Gavilán Chavez, Ronnie Gustavo
Vibrio parahaemolyticus es un patógeno facultativo que causa infecciones gastrointestinales asociadas al consumo de productos marinos, las cuales se han convertido en un problema de salud pública en diversas regiones del mundo. Los reportes en Perú no representan apropiadamente la tasa real de casos debido a factores como la automedicación y el bajo poder discriminatorio de los métodos convencionales de tipificación. Frente a ello, las herramientas moleculares basadas en epidemiología molecular brindan una solución para la obtención de datos importantes en investigaciones de brotes. Por ende, el objetivo del presente trabajo fue estudiar la diversidad molecular de V. parahaemolyticus clínicos mediante tipificación multilocus (MLST). Setenta genomas de V. parahaemolyticus pertenecientes a muestras de origen peruano se incluyeron en el análisis. Las muestras fueron obtenidas durante el periodo 1995-2007. A partir de los genomas se obtuvo información que involucra genotipos (STs), estructura poblacional, relación filogenética y la presencia o ausencia de factores de virulencia como las islas de patogenicidad (VpaI). Se identificaron 11 STs diferentes, cinco de ellos responsables de importantes epidemias en el pasado: ST3 (n=31), ST120 (n=22), ST265 (n=6), ST88 (n=3) y ST36 (n=2), destacando particularmente el ST3, por presentar predominancia numérica y temporal en los aislados. Por otro lado, la relación filogenética demostró la clonalidad de los aislados, formando clústeres entre cepas pertenecientes al mismo genotipo. Además, se detectó que la mayoría de aislados presentaron genes que codifican a las hemolisinas TDH y TRH, y los genes de las VpaI 1 al 7. Se concluye que, durante el periodo estudiado, predominaron los aislados del genotipo ST3, poseedores de importantes factores de virulencia y asociados a importantes epidemias años atrás. Adicionalmente, se encontró la circulación de genotipos poco estudiados en Perú y el mundo, pero con potencial patogénico latente, por lo cual se enfatiza la importancia del empleo de técnicas moleculares en la vigilancia epidemiológica de V. parahaemolyticus para el rastreo de genotipos con potencial epidémico a futuro.
Filogenómica y resistencia antimicrobiana de aislados humanos de Salmonella enterica no tífica circulantes en Perú durante el periodo 1998 - 2018
(Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2025) Caro Castro, Junior Jair; García de la Guarda, Ruth Hortensia
Las infecciones por Salmonella no tifoidea (NTS) constituyen un relevante problema de salud pública debido a su amplia distribución geográfica, alta incidencia y al incremento de la resistencia a los antimicrobianos, especialmente en países en desarrollo como el Perú; en ese contexto, el objetivo de la presente investigación fue determinar la diversidad filogenómica de aislados de NTS circulantes en el país durante el periodo 1998-2018. El estudio se desarrolló a partir de una colección de cepas viables pertenecientes al Instituto Nacional de Salud, previamente caracterizadas como Salmonella spp., las cuales fueron secuenciadas mediante tecnología Illumina®, sometidas a control de calidad y ensamblaje genómico. Posteriormente, se realizaron análisis de asignación de secuenciotipos (ST), inferencia filogenética, detección de genes de resistencia y virulencia, identificación de elementos genéticos móviles y análisis genómico comparativo de los principales STs. Los resultados permitieron identificar 40 secuenciotipos diferentes, siendo los más frecuentes S. Infantis ST-32 (37,3 %), S. Enteritidis ST-11 (23,8 %), S. Typhimurium ST-19 (14,2 %), S. Newport ST-31 (6,77 %) y S. Mbandaka ST-413 (4,7 %); la filogenia evidenció una alta clonalidad entre cepas del mismo ST, independientemente de la fuente de aislamiento. Asimismo, se observó una fuerte asociación de genes de virulencia, plásmidos y profagos con los STs más frecuentes, mientras que los genes de resistencia antimicrobiana se asociaron principalmente a S. Infantis ST-32. En conclusión, el estudio describe por primera vez la dinámica de los secuenciotipos de NTS circulantes en el Perú, evidenciando características genómicas que sugieren una elevada adaptación de estas cepas y resaltando la importancia de la secuenciación del genoma completo como herramienta clave para la vigilancia, prevención y control de patógenos transmitidos por alimentos.