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Estructura genética poblacional de Phyllodactylus sentosus (Squamata: Phyllodactylidae) mediante Genotipado por Secuenciación (GBS)
(Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2021) Arana Salinas, Alejandra Dafne; Ramirez Malaver, Jorge Luis
La pérdida y fragmentación de hábitats naturales a causa de la urbanización es una importante amenaza a la biodiversidad. El gecko de Lima Phyllodactylus sentosus es una especie endémica del Perú, considerada en Peligro Crítico, que se refugia en las áreas arqueológicas de la ciudad de Lima, también conocidas como huacas. Utilizando información obtenida mediante la técnica de Genotipado por Secuenciación se analizó la estructura genética poblacional del gecko de Lima para evaluar los factores que influyen en ésta. Los resultados indican alta diferenciación entre las poblaciones, aunque no estén alejadas, indicando que la urbanización y la consecuente modificación del hábitat de esta especie implica barreras para el flujo génico entre las poblaciones que se encuentran refugiadas en las huacas de Lima.
Flujo génico e historia demográfica de Phyllodactylus sentosus (Squamata: Phyllodactylidae) mediante Genotipado por Secuenciación (GBS)
(Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2023) Arana Salinas, Alejandra Dafne; Ramirez Malaver, Jorge Luis
Exponen cómo La urbanización y la consecuente modificación antrópica del hábitat afecta a las poblaciones silvestres que residen en parches remanentes, pudiendo disminuir el flujo génico entre estas poblaciones y elevar la endogamia, y, por lo tanto, afectar la viabilidad de estas poblaciones. El flujo génico y la historia demográfica del gecko de Lima Phyllodactylus sentosus, una especie endémica del Perú y en peligro crítico, fueron analizados usando Genotipado por Secuenciación. Las poblaciones remanentes de esta especie en Lima se refugian en las “huacas” de la ciudad, áreas arqueológicas que conservan las características áridas del hábitat natural costero. Las bajas tasas de migración relativas entre las poblaciones estudiadas, y la falta de señal de aislamiento-por-distancia, indican que la ocupación humana y la consecuente modificación del hábitat de esta especie implican barreras para el flujo génico. Asimismo, la estimación de la historia demográfica de esta especie identificó un cuello de botella hace aproximadamente cuatro a seis mil años atrás, probablemente asociado a las primeras modificaciones del valle limeño por poblaciones preincas. Se recomienda que una medida de conservación eficaz para el gecko de Lima debe considerar la restauración de la conectividad entre sus poblaciones, por ejemplo, mediante el rescate genético a través de la migración asistida por el hombre.
Variación geográfica de la diversidad filogenética de comunidades de aves en la amazonía peruana
(Universidad Nacional Mayor de San Marcos, 2024) Arana Salinas, Alejandra Dafne; Ramirez Malaver, Jorge Luis
El análisis de la variación geográfica de la diversidad filogenética de aves (que representa tanto su historia como su potencial evolutivo) es particularmente significativo en la Amazonia peruana, una región con alta riqueza de especies de aves y que enfrenta graves amenazas a la biodiversidad. Este estudio analiza cómo la diversidad filogenética de las comunidades de aves amazónicas peruanas (ponderada con la abundancia o sin ponderar) varía a lo largo de gradientes latitudinales y altitudinales, así como el efecto de factores ambientales en los patrones de variación y en la composición taxonómica y filogenética de estas comunidades. Entre los factores ambientales analizados se incluyen la temperatura, la precipitación, la cercanía a centros poblados, la heterogeneidad de los ecosistemas en el área analizada y la heterogeneidad de la estructura del bosque. Para determinar la diversidad taxonómica y filogenética, se emplearon datos de conteo por puntos de 22 zonas repartidas en once departamentos de Perú. Adicionalmente, se realizó un análisis de diversidad filogenética enfocado en la familia Thraupidae, basado en una filogenia actualizada con la adición de información genética obtenida mediante el uso de código de barras de ADN de muestras colectadas en Perú. El análisis de las comunidades de aves reveló una reducción en la diversidad filogenética a lo largo de la gradiente altitudinal y un aumento en las latitudes más bajas. Asimismo, se registró un aumento de la diversidad filogenética relacionado a temperaturas más altas y a una mayor distancia de la zona de estudio al pueblo más cercano. Por otro lado, se detectó mayor riqueza taxonómica y diversidad filogenética de aves de la familia Thraupidae en áreas a mayor altitud, menor temperatura, menor precipitación y menor altura del dosel. La temperatura, la altura del dosel del bosque y la heterogeneidad de la estructura del bosque se identificaron como factores ambientales importantes que determinan la composición de las comunidades de aves. Finalmente, la distancia del área evaluada al pueblo más cercano también influye en la composición de las comunidades, lo que enfatiza la importancia de la protección de áreas prístinas. El presente estudio representa el análisis más completo a la fecha de la influencia de factores ambientales sobre los patrones geográficos de diversidad filogenética en aves del Perú.